1、包裝不同：

因為飛天茅臺一開始就是用作外銷的，為了彰顯國酒的品質，茅臺酒廠也較注重飛天，不論是酒瓶、包裝、防偽方面都比五星好，顯得一些。

2、價格不同

每生產一瓶飛天茅臺就要向貴州省糧油進出口公司支付必定的商標費用，而五星茅臺就沒有這個費用。還有一點，飛天配2個小酒杯，五星沒有。所以飛天茅臺比五星茅臺貴一點。

3、商標不同

1954年5月1日，茅臺酒廠成功注冊了“金輪牌”商標，也就是那個麥穗圍繞著五星的商標，這個商標就是五星茅臺的前身。

實際上當年商標局注冊的“飛天”商標共有兩枚，它們都原歸于貴州省糧油進出口公司，一枚是“飛天童子獻酒圖”，即如今飛天茅臺瓶身上的那枚。