北京同仁醫(yī)院以醫(yī)院綜合醫(yī)療為主體，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所為附屬科研機構(gòu)，形成 “一院三所”發(fā)展格局，成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為國家臨床重點學科，變態(tài)反應(鼻過敏)科為國家臨床重點?？?，中醫(yī)眼科學為中醫(yī)重點學科。

北京同仁醫(yī)院作為首都醫(yī)科大學第四臨床醫(yī)學院，醫(yī)院承擔著重要的教學任務;首都醫(yī)科大學北京眼科學院和耳鼻咽喉科學院設在醫(yī)院內(nèi)。醫(yī)院現(xiàn)有研究生學位點28個，其中博士學位點13個;碩士研究生導師163名，其中博士研究生導師67名，國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓專業(yè)基地16個。2012年以來，醫(yī)院獲批項目(課題)243項，獲省部級及以上(含社會力量獎)31項，其中國家獎3項。

在臨床相關(guān)研究方面，北京同仁醫(yī)院眼底科開展了增生性玻璃體視網(wǎng)膜病變發(fā)病機制的研究，視網(wǎng)膜下人工假體植入技術(shù)及組織相容性研究，高度近視眼致病基因定位及蛋白質(zhì)組學分析，黃斑營養(yǎng)不良的致病基因定位研究，年齡相關(guān)性黃斑變性發(fā)病危險因素和早期干預研究，以及眼病的流行病學研究等。持續(xù)不斷的獲得了多項及省部級課題經(jīng)費的支持。發(fā)表了系列高質(zhì)量研究論文，形成了同仁品牌效應和國際影響力。

玻璃體視網(wǎng)膜疾病的臨床工作是眼底病專業(yè)的核心工作方向和職責所在。年門診量近19萬人次，年手術(shù)量1.4萬人次，高難度3-4級手術(shù)占比>97%。北京同仁醫(yī)院眼底科在糖尿病視網(wǎng)膜病變、年齡相關(guān)性黃斑變性、視網(wǎng)膜靜脈阻塞、視網(wǎng)膜脫離、脈絡膜黑色素瘤等各類眼底疾病的診療方面具有豐富的經(jīng)驗。