在醫(yī)療實踐的同時，曾學軍教授致力于臨床醫(yī)學教育，任美國內(nèi)科醫(yī)師學會（ACP）Fellow、美國醫(yī)學研究所（IOM）中國醫(yī)學教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫(yī)師心中好老師”、北京市師德先進個人、北京協(xié)和醫(yī)學院教學名師等榮譽，帶領普通內(nèi)科獲得2015年北京協(xié)和醫(yī)學院教學團隊稱號。2019年2月入選十大社區(qū)健康促進首 席專家。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科為了促進中國風濕病的普及與提高，自建科以來，堅持每年舉辦形式多樣的風濕病學講習班和學術會議，編著多部風濕病學專著，同時結合風濕病學臨床的需要開展科學研究，取得了極大的成績，是國家教委風濕病學博士學位授予點、風濕免疫內(nèi)科博士后流動站、國家教委風濕病學重點學科單位、衛(wèi)生部住院醫(yī)師培訓基地、風濕免疫科專科繼續(xù)教育基地、風濕臨床試驗基地、教育部重點實驗室，風濕病學博士生/博士后培養(yǎng)單位，為全國培養(yǎng)了大量風濕病學的專業(yè)人才。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科被業(yè)界稱為中國風濕病學科的“黃埔軍?！薄?979年，在“中國風濕病學之父”張乃崢教授的帶領下，北京協(xié)和醫(yī)院成立了中國蕞早的風濕免疫學組，翻開了中國風濕病學事業(yè)的嶄新篇章。四十余年來，在幾代協(xié)和風濕免疫人的辛勤奮斗下，科室蓬勃發(fā)展，引領并見證了我國風濕病學事業(yè)從無到有、自小變大、由弱變強。

2020年8月，北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科實驗室完成了靶抗原特異性標志物的全部項目方法學升級，由傳統(tǒng)手工、批量操作、定性檢測的酶聯(lián)免疫吸附測定（ELISA）升級為全自動、實時進樣、高通量、定時檢測的化學發(fā)光檢測方法，可檢測自身抗體60余種。這也是國內(nèi)三甲醫(yī)院第 一條專門用于自身抗體檢測的全自動流水線，日運行通量可達1.5萬次。報告時間縮短到0.5至1個工作日，為患者的精 準診斷提供了重要支撐。