北京301醫(yī)院先后被評為“國際模范愛嬰醫(yī)院”、“全國百佳醫(yī)院”、“全國百姓放心醫(yī)院”、“全國百姓放心示范醫(yī)院”、“全軍為部隊服務先進醫(yī)院”，榮獲全國衛(wèi)生系統(tǒng)“文化建設創(chuàng)新獎”、國家衛(wèi)生部授予“醫(yī)院改革創(chuàng)新獎”。

北京301醫(yī)院先后獲得省部級以上科技成果獎勵1300余項，其中，國家科技進步一等獎7項，二等獎22項，國家發(fā)明獎3項，軍隊科技進步一等獎21項。醫(yī)院承擔“973”、“863”等各類課題800多項，在中國國內、國際公開發(fā)表的論文總數和國內論文被引用次數連續(xù)4年居全國醫(yī)院之首。

令狐恩強提出的診斷與治 療一體的LDRf分型記錄法，是全世界首 個覆蓋全消化道的靜脈曲張分型記錄法，在全國使用；提出的肝移植術后ERCP膽管狹窄的A/B/C/D 分型法對膽管狹窄的治 療具有一定的指導意義；提出的賁門失弛緩內鏡下I/II/III分型法、與黏膜粘連度a/b/c/d/e/f分級法填補了國際空白，為消化內鏡隧道技術的適應證與禁忌癥的制定奠定了基礎。

令狐恩強說，在2010年前后，我國提出消化內鏡診治新模式的概念，來踐行早診早治的理念。一方面是把檢查切入點從有癥狀期提前到無癥狀期，另一方面則是形成以消化內鏡治 療為主，外科手術切除為輔，放化療為補充的一套全新的治 療概念。該理念保證了患者能在早期就能被發(fā)現(xiàn)，并進行有效的內鏡下治 療，具有良好的社會意義和經濟效益。