在功能分區(qū)上，綜合來說主工藝流要根據(jù)工藝步驟和各工序的物特點進行功能分區(qū)，如細胞庫區(qū)、工藝細胞庫配置區(qū)、種子庫、工作種子庫制備區(qū)、原液區(qū)、純化區(qū)，包裝區(qū)等，并且要考慮不同的潔凈級別，也是考慮不同的潔凈級別區(qū)域劃分布置的問題，還有就是產(chǎn)品有/性、細胞活性/非細胞活性、滅活/非滅活等情形進行一下分區(qū)。

在疫苗生產(chǎn)中，有毒區(qū)與區(qū)要嚴格分區(qū)，并且有毒區(qū)要保持負壓，保證毒物無外泄，對于單抗類的產(chǎn)品主要考慮有無細胞活性。主工藝流要考慮特殊工藝的要求，如要區(qū)分單體疫苗和聯(lián)合疫苗、單價疫苗和多價疫苗、批次培養(yǎng)生產(chǎn)線和灌流培養(yǎng)生產(chǎn)線，聯(lián)合疫苗肯定有一個聯(lián)苗配制的過程，要考慮不同的分區(qū)，讓幾個單體單獨生產(chǎn)，同時聯(lián)合配制的過程也要更加方便。

對于輔助生產(chǎn)區(qū)的功能分區(qū)要和主生產(chǎn)區(qū)進行合理配合，清洗和區(qū)域要和服務的主工藝流區(qū)域靠近，如果為多個公共服務區(qū)，那么要盡可能的居中布置，為物品傳遞提供便利。物料儲存區(qū)的設計要便于物料進出，減少長距離的傳輸，設備的輔機間要設計在潔凈區(qū)外面，在非潔凈區(qū)進行維護保養(yǎng)。以筆者的經(jīng)驗，在合理的位置增加中控區(qū)，可減少來往實驗室的次數(shù)，有利于提升工作效率。

物料凈化方面依據(jù)以下原則：

1、醫(yī)藥潔凈室的原輔料、包裝材料和其他物品出入口,設置物料凈化用室和設施。

并在岀入口設置供物料、物品用的室和設施。

2、物料清潔室或室與醫(yī)藥潔凈室之間設置氣鎖或傳遞柜，氣鎖的靜態(tài)凈化級別與其相鄰高級別醫(yī)藥潔凈室一致。

3、傳遞柜密閉良好,易于清潔。兩邊的傳遞門設有防止同時被開啟的措施，傳送至無菌生產(chǎn)潔凈室的傳遞柜設有相應的凈化設施。

4、醫(yī)藥潔凈室產(chǎn)生的廢棄物設有傳出通道，易產(chǎn)生污染的廢棄物設置單獨的出口，具有活性或毒性的生物廢棄物滅活后傳出。