注冊會計師在這個審計階段，實(shí)質(zhì)上是對企業(yè)依據(jù)內(nèi)控制度所進(jìn)行的經(jīng)營活動和實(shí)施管理行為的合法性進(jìn)行評價裁定，從而使企業(yè)行為得到規(guī)范，并步入良性發(fā)展的道路。 在資本市場上，會計師事務(wù)所通過向社會披露募股公司的資產(chǎn)重組計劃、募集資金的用途、預(yù)期收益等信息，引導(dǎo)股民的資本投向。

注冊會計師對企業(yè)進(jìn)行獨(dú)立審計，首先要對企業(yè)遵守制度情況進(jìn)行符合性測試，并對企業(yè)的內(nèi)部控制制度進(jìn)行評價。一方面對企業(yè)的內(nèi)控制度是否遵守一貫性原則發(fā)表意見;另一方面判斷企業(yè)的財務(wù)報告是否在所有重大方面公允地反映了企業(yè)的財務(wù)狀況、經(jīng)營成果和資金變動情況。從而確定抽樣審計的范圍、樣本數(shù)量和審計重點(diǎn)。

會計事務(wù)所的部門從大的角度來說主要分兩塊：一塊是業(yè)務(wù)部門，主要有主要的審計部門，以及企業(yè)風(fēng)險管理部、稅務(wù)部和咨詢部(分為管理咨詢和財務(wù)咨詢)等等。另一塊就是后勤部門，主要包括人力、財務(wù)等。

在事務(wù)所執(zhí)業(yè)的項目負(fù)責(zé)人、項目經(jīng)理都是已經(jīng)取得注冊會計師證書的注冊會計師，他們是事務(wù)所的核心人物，另外聘用大量的審計助理，做具體審計工作，實(shí)際工作一般都相當(dāng)累，時間長任務(wù)重，出差多工作量大。項目結(jié)束后審計報告由注冊會計師出具并簽字。