三格式化糞池是由三個相互連通的密封糞池組成，糞便由進糞管進入池依此順流至第三池，其各池的主要原理：

池：主要截留含蟲卵較多的糞便，糞便經(jīng)發(fā)酵分解，松散的糞塊因發(fā)酵膨脹而浮升，比重大的下沉，因而形成上浮的糞皮、中層的糞液和下沉的糞渣。利用寄生蟲的比重大于糞尿混合液的原理使其自然沉降于化糞池底部。利用糞液的浸泡和翻動化解糞塊使其液化并截留糞渣于池底。厭氧發(fā)酵：化糞池的密閉厭氧環(huán)境，可以分解蛋白性有機物，并產(chǎn)生氨等物質(zhì)，這些物質(zhì)具有殺滅寄生蟲卵及病菌的作用。

第二池：起進一步發(fā)酵、沉淀作用，與池相比，第二池的糞皮和糞渣的數(shù)量減少，因此發(fā)酵分解的程度較低，由于沒有新糞便的進入，糞液處于比較靜止狀態(tài)，這有利于漂浮在糞池中的蟲卵繼續(xù)下沉。

第三池：主要起儲存糞液的作用。經(jīng)前二格處理的糞液進入第三池，基本上已經(jīng)不含寄生蟲卵和病原微生物，達到了糞便無害化要求，可以供農(nóng)田直接施肥。

化糞池清理程序：鉤打開化糞池的蓋板敞開15分鐘，把吸糞車開到工作現(xiàn)場，套好吸糞管放入化糞池內(nèi)，再用鐵鏟攪動化糞池內(nèi)糞便結塊層，一邊放水一邊攪動，啟動吸糞車開關，吸出糞便直至化糞池內(nèi)的結塊物吸完為止，蓋回化糞池蓋板，用清水沖洗凈工作現(xiàn)場。

貯糞池由二根過糞管連通的三個格室的密封池組成。根據(jù)其主要功能依次可命名為截留沉淀與發(fā)酵池、再次發(fā)酵池和貯糞池。三池之間由過糞管連接。有斜插管及倒U形、倒L形管等，但以斜插管為。過糞管采用內(nèi)徑為100～150mmPVC塑料管為宜，也可以用水泥預制、陶管等其它材料、要求內(nèi)壁光滑。為防止堵塞，考慮糞池的大小與流量，可適當增加過糞管的數(shù)量。

按照化糞池的技術標準，化糞池的污泥清掏時間一般為90天、180天、360天，被清掏的污泥可以作為有機肥料，或者進行無害化處置。但是，隨著化肥的廣泛使用，社會的發(fā)展，使用糞便肥料越來越少，與此同時，我國污泥處置行業(yè)嚴重滯后，糞便污泥的無害化處理不足，我國13.6億人每年產(chǎn)生超億噸的糞便污泥，根據(jù)統(tǒng)計局數(shù)據(jù)，2012年無害化處理的糞便污泥只有801.4萬噸。大量糞便污泥的清掏轉(zhuǎn)移，造成了二次污染。因此，如果不能解決化糞池污泥的無害化處置問題，化糞池污泥就會成為水污染的污染源，化糞池問題是關系水污染治理成效的環(huán)保問題。