實驗室布局按照要求合理地劃分成清潔區(qū)、半污染區(qū)和污染區(qū)，采用人與物分別設(shè)置專用通道，設(shè)置必要的緩沖間，采用一次隔離和二次隔離等措施，能有效的避免交叉污染，從根本上防止危險性微生物的擴散;實驗室裝修采用可靠的材料，合理的施工措施，保證潔凈實驗室-生物實驗室始終處于相對密封的環(huán)境，防止微生物的外逸，易于實驗室的清潔，同時避免外部對實驗室環(huán)境的破壞。

控制系統(tǒng)：是整個潔凈實驗室-生物實驗室運行的神經(jīng)中樞。由于潔凈實驗室-生物實驗室的實驗對象是危險性的微生物，出于嚴(yán)格控制污染的原則，它要求以少的維護人員，運用化的管理維護手段，來實時監(jiān)控每一個實驗室中設(shè)備所處的物理環(huán)境，保證實驗室運行過程中始終處于相對負(fù)壓環(huán)境，防止危險性微生物外泄。

單向流潔凈室一般有兩種類型，即水平流和垂直流。在水平流系統(tǒng)中，氣流是從一面墻流向另一面墻。在垂直流系統(tǒng)中，氣流是從吊頂流向地面。對要求潔凈室的懸浮粒子濃度或微生物濃度更低的場合，就使用單向氣流。

但在一個操作間，機器以及機器周圍走動的人員，會對氣流形成障礙。障礙物可以使單向流變成紊流，從而在障礙物周圍形成氣流團。人員的活動也可以使單向流變成紊流。在這些紊流中，由于風(fēng)速較低，空氣稀釋程度較小，從而使得污染濃度較高。